Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX1AQ16623 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX1AQ16623 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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