Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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