Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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