Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL23Q16540 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms