Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK5Q16478 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK5Q16478 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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