Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85BQ15834 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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