Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIV2LQ15477 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIV2LQ15477 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms