Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH1Q15438 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTH1Q15438 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms