Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms