Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PUM3Q15397 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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