Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCM1Q15154 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCM1Q15154 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCM1Q15154 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCM1Q15154 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCM1Q15154 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms