Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK3Q15120 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PDK3Q15120 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK3Q15120 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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