Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK2Q15119 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK2Q15119 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms