Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3GAP1Q15042 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3GAP1Q15042 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3GAP1Q15042 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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