Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAPTM4AQ15012 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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