Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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IRF3Q14653 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF3Q14653 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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