Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms