Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM29Q14134 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM29Q14134 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM29Q14134 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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