Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOP3AQ13472 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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