Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LSAMPQ13449 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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