Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSLNQ13421 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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