Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERCC8Q13216 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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ERCC8Q13216 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERCC8Q13216 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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