Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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