Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXF2Q12947 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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