Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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