Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 PHO13YDL236W 939 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ACP1YKL192C 378 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 IES3YLR052W 753 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 INA17YPL099C 549 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 snR37snR37 386 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MRPL37YBR268W 318 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 UGA3YDL170W 1587 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 CLB5YPR120C 1308 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MIH1YMR036C 1665 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ABP140YOR239W 1887 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 APC4YDR118W 1959 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RXT3YDL076C 885 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ARG82YDR173C 1068 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 SNA2YDR525W-A 240 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 POP6YGR030C 477 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ECM34YHL043W 513 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 BMT5YIL096C 1011 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 LSO1YJR005C-A 282 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YKL177WYKL177W 339 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YAR023CYAR023C 540 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YNL181WYNL181W 1224 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 POP3YNL282W 588 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 IDI1YPL117C 867 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RKM3YBR030W 1659 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YER077CYER077C 2067 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YCR101CYCR101C 549 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MSS2YDL107W 1056 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ARF2YDL137W 546 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RPS13YDR064W 456 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ADH4YGL256W 1149 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YHB1YGR234W 1200 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 LSM12YHR121W 564 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RAD27YKL113C 1149 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RTK1YDL025C 1863 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 DPH6YLR143W 2058 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 COX4YGL187C 468 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 IBD2YNL164C 1056 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 CEG1YGL130W 1380 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 NAM9YNL137C 1461 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 SAP4YGL229C 2457 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 ARX1YDR101C 1782 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RPC17YJL011C 486 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 TFA2YKR062W 987 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 IDP2YLR174W 1239 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 GCD7YLR291C 1146 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RNA1YMR235C 1224 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 RRN9YMR270C 1098 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 WRS1YOL097C 1299 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 FSH3YOR280C 801 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 SSH4YKL124W 1740 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC39Q12745 MTR10YOR160W 2919 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 VPS45YGL095C 1734 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 RCM1YNL022C 1473 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 RPC53YDL150W 1269 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 NUS1YDL193W 1128 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YFT2YDR319C 825 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 HIS6YIL020C 786 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SAP30YMR263W 606 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 UTP23YOR004W 765 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 ECM23YPL021W 564 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PUF2YPR042C 3228 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SYF1YDR416W 2580 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 IOC2YLR095C 2439 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YDL094CYDL094C 510 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YDR222WYDR222W 1248 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 KRE28YDR532C 1158 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 GVP36YIL041W 981 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 DID4YKL002W 699 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 NIT3YLR351C 876 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YBL036CYBL036C 774 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 ATG8YBL078C 354 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YBL094CYBL094C 333 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 UMP1YBR173C 447 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 FYV5YCL058C 459 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SRS2YJL092W 3525 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PDR12YPL058C 4536 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 CDC9YDL164C 2268 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 FRT2YAL028W 1587 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MLH2YLR035C 2088 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YGR149WYGR149W 1299 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MMM1YLL006W 1281 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YLL047WYLL047W 384 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YBL059WYBL059W 582 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 TMA16YOR252W 537 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 ICY2YPL250C 411 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 IPI3YNL182C 1668 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 CLN2YPL256C 1638 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 UBP6YFR010W 1500 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 EXO70YJL085W 1872 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YCL068CYCL068C 783 nt4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms