Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 TGS1YPL157W 948 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 STU2YLR045C 2667 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 NUS1YDL193W 1128 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 PDR12YPL058C 4536 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 SSB1YDL229W 1842 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 EPL1YFL024C 2499 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 MET7YOR241W 1647 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 IKI3YLR384C 4050 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 KRE5YOR336W 4098 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 FRE8YLR047C 2061 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 YPL260WYPL260W 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 RPL18AYOL120C 561 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 PAP2YOL115W 1755 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 YGR266WYGR266W 2106 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 DHR2YKL078W 2208 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 SYF1YDR416W 2580 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 DPB2YPR175W 2070 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 CUE3YGL110C 1875 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 RPL23BYER117W 414 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 AVT7YIL088C 1473 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 SIS2YKR072C 1689 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 HOT1YMR172W 2160 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 FAA2YER015W 2235 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 IMD4YML056C 1575 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 ASI1YMR119W 1875 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 YOR331CYOR331C 558 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 PRP43YGL120C 2304 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 YOL153CYOL153C 1746 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1B-BLQ12490 BCH1YMR237W 2175 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 NFT1YKR103W 3657 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 MIG3YER028C 1185 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 GET1YGL020C 708 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 SHG1YBR258C 429 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 ALA1YOR335C 2877 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 RPC37YKR025W 849 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 GEM1YAL048C 1989 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 CHS3YBR023C 3498 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 MDN1YLR106C 14733 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 PRE1YER012W 597 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YGL074CYGL074C 327 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 NIT3YLR351C 876 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YBL108WYBL108W 306 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 POL31YJR006W 1464 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 SUP45YBR143C 1314 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 ITC1YGL133W 3795 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 DOG1YHR044C 741 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 GRC3YLL035W 1899 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 SSE2YBR169C 2082 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 SKI6YGR195W 741 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 SEC18YBR080C 2277 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 REC8YPR007C 2043 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 VPS64YDR200C 1815 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 BCD1YHR040W 1101 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YPL113CYPL113C 1191 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 COA2YPL189C-A 207 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 TLC1TLC1 1301 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 TIP20YGL145W 2106 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YDL176WYDL176W 2127 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 THI20YOL055C 1656 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 TIF4632YGL049C 2745 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 MUP3YHL036W 1641 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YHL049CYHL049C 816 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 YJR085CYJR085C 318 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 RFM1YOR279C 933 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BLQ12490 GPI10YGL142C 1851 nt4.59□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 XRS2YDR369C 2565 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 PPH3YDR075W 927 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RPB9YGL070C 369 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 YAL004WYAL004W 648 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 CBT1YKL208W 816 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 HBT1YDL223C 3141 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 NUP133YKR082W 3474 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 MEK1YOR351C 1494 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 BIO2YGR286C 1128 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RPS12YOR369C 432 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RRN11YML043C 1524 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 HER2YMR293C 1395 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 GIS2YNL255C 462 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RPO26YPR187W 468 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 VPS41YDR080W 2979 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 PPZ1YML016C 2079 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 YAK1YJL141C 2424 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 CDC40YDR364C 1368 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 NOP2YNL061W 1857 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RAD26YJR035W 3258 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 PRP9YDL030W 1593 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 STE6YKL209C 3873 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 KCH1YJR054W 1494 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 YLR257WYLR257W 966 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 PNG1YPL096W 1092 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RIM21YNL294C 1602 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 RPN3YER021W 1572 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 NAB6YML117W 3405 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BLQ12490 GPI14YJR013W 1212 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BLQ12490 BMS1YPL217C 3552 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BLQ12490 ROG1YGL144C 2058 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BLQ12490 NUP85YJR042W 2235 nt4.52□□□□□ -1.69
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