Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPSF1Q10570 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPSF1Q10570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
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