Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN5Q08AF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms