Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 GRX6YDL010W 696 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YDL241WYDL241W 372 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 NBP2YDR162C 711 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RSF1YMR030W 1131 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YMR130WYMR130W 909 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SPS4YOR313C 1017 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PRP43YGL120C 2304 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 BLM10YFL007W 6432 nt2.9□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PUF2YPR042C 3228 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 TPO2YGR138C 1845 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 AVT1YJR001W 1809 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CDC9YDL164C 2268 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RIA1YNL163C 3333 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RTK1YDL025C 1863 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YDL124WYDL124W 939 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 IRC6YFR043C 714 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SAY1YGR263C 1275 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YKE4YIL023C 1041 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YIL089WYIL089W 618 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YAE1YJR067C 426 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 KTR2YKR061W 1278 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YNL234WYNL234W 1281 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YOL024WYOL024W 519 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YPL162CYPL162C 822 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 MET16YPR167C 786 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 THI7YLR237W 1797 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CWH43YCR017C 2862 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 UPC2YDR213W 2742 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SEN1YLR430W 6696 nt2.89□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 ACE2YLR131C 2313 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 LTV1YKL143W 1392 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 TGL4YKR089C 2733 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 FAR8YMR029C 1572 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 MSW1YDR268W 1140 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YHR173CYHR173C 339 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CPR3YML078W 549 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RPS19AYOL121C 435 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 DCS2YOR173W 1062 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YOL075CYOL075C 3885 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 VHC1YBR235W 3363 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 AIP1YMR092C 1848 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 HMS1YOR032C 1305 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CLB5YPR120C 1308 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PHO87YCR037C 2772 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SNF2YOR290C 5112 nt2.88□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 HSP42YDR171W 1128 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RMD5YDR255C 1266 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 BIO2YGR286C 1128 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YHL045WYHL045W 348 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 BAT2YJR148W 1131 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 FLD1YLR404W 858 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 MCM1YMR043W 861 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YMR084WYMR084W 789 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 POP3YNL282W 588 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 AIM39YOL053W 1188 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 VPS21YOR089C 633 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 FSH3YOR280C 801 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YMR1YJR110W 2067 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 MDM38YOL027C 1722 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SSL1YLR005W 1386 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SKG6YHR149C 2205 nt2.87□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YPK9YOR291W 4419 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 EXO70YJL085W 1872 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 NAM9YNL137C 1461 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RCR2YDR003W 633 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SDT1YGL224C 843 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YGR219WYGR219W 342 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YHB1YGR234W 1200 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 HIS5YIL116W 1158 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 FMP33YJL161W 543 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RPL18BYNL301C 561 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CNS1YBR155W 1158 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PRP19YLL036C 1512 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PRP28YDR243C 1767 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YBR225WYBR225W 2703 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PFK1YGR240C 2964 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SRO9YCL037C 1305 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 SAC1YKL212W 1872 nt2.86□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 PUT2YHR037W 1728 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 RAD16YBR114W 2373 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YDR230WYDR230W 348 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 CIR1YGR207C 786 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 ATP12YJL180C 978 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 YKL177WYKL177W 339 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 HRT3YLR097C 1035 nt2.85□□□□□ -1.95
RDS3Q06835 BLS1YLR408C 369 nt2.85□□□□□ -1.95
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