Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTBQ06643 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms