Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABPAQ06546 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms