Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1T1Q06455 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms