Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC18A2Q05940 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms