Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms