Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1Q04771 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACVR1Q04771 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms