Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TLE4Q04727 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLE4Q04727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms