Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms