Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP2Q03169 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms