Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4A11Q02928 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4A11Q02928 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4A11Q02928 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4A11Q02928 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4A11Q02928 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4A11Q02928 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms