Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A3Q01959 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A3Q01959 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms