Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPIBQ01892 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPIBQ01892 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms