Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB1Q01826 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms