Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA5Q01523 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms