Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEX3Q00994 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEX3Q00994 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms