Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms