Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMAD3P84022 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD3P84022 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD3P84022 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms