Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P62684 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms