Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF6P62330 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF6P62330 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARF6P62330 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARF6P62330 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARF6P62330 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARF6P62330 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms