Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-16P61578 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-16P61578 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms